Η αφαίρεση της εξωμητρίου κύησης γίνεται στις μέρες μας σχεδόν πάντα λαπαροσκοπικά. Μέσω δυο μέχρι τεσσάρων πολύ μικρών τομών ο γυναικολόγος βλέπει την εξωμήτριο κύηση που συνήθως βρίσκεται σε μια εκ των δυο σαλπίγγων.
Το χειρουργείο μπορεί να γίνει με διατήρηση της πάσχουσας σάλπιγγας και αφαίρεση της εξωμητρίου κύησης
Η απόφαση για να διατηρηθεί η πάσχουσα σάλπιγγα γίνεται κατά τη διάρκεια του χειρουργείου, εάν βρεθεί ότι και η άλλη (ετερόπλευρη σάλπιγγα) είναι παθολογική.
Έτσι για να διατηρηθεί η πιθανή μελλοντική γονιμότητα της γυναίκας μπορεί να διατηρηθεί η σάλπιγγα. Αυτό βεβαίως αυξάνει την πιθανότητα εξωμήτριου κύησης στο μέλλον, με πιθανότητες περίπου 1:5 έναντι του 1:10 σε περίπτωση αφαίρεσης όλης της σάλπιγγας.
